Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REREQ9P2R6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REREQ9P2R6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms