Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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