Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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