Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC3Q14574 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC3Q14574 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms