Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms