Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms