Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms