Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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