Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms