Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms