Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP3P54852 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP3P54852 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP3P54852 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP3P54852 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP3P54852 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms