Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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