Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF3IP2O43734 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms