Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp1Q9Z273 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms