Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ChmQ9QXG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms