Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrac1Q9JKP8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chrac1Q9JKP8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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