Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrnb2Q9ERK7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrnb2Q9ERK7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms