Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr1Q9EPQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms