Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn9Q9D805 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn9Q9D805 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn9Q9D805 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms