Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms