Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok2Q9CQS5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok2Q9CQS5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms