Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQ90 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQ90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQ90 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQ90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQ90 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms