Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trps1Q925H1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trps1Q925H1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trps1Q925H1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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