Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripply3Q924S9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ripply3Q924S9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ripply3Q924S9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms