Protein–RNA interactions for Protein: Q923J1

Trpm7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm7Q923J1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm7Q923J1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm7Q923J1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm7Q923J1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm7Q923J1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm7Q923J1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm7Q923J1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm7Q923J1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms