Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim59Q922Y2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim59Q922Y2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms