Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr6Q8VE11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr6Q8VE11 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr6Q8VE11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms