Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms