Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Agr3Q8R3W7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Agr3Q8R3W7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Agr3Q8R3W7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Agr3Q8R3W7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Agr3Q8R3W7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Agr3Q8R3W7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Agr3Q8R3W7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms