Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmpQ8R373 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmpQ8R373 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClmpQ8R373 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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