Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2f4Q8R0K9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f4Q8R0K9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2f4Q8R0K9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2f4Q8R0K9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2f4Q8R0K9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms