Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud6bQ8K2H2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6bQ8K2H2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6bQ8K2H2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms