Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cc2d2aQ8CFW7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cc2d2aQ8CFW7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cc2d2aQ8CFW7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cc2d2aQ8CFW7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Cc2d2aQ8CFW7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cc2d2aQ8CFW7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cc2d2aQ8CFW7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cc2d2aQ8CFW7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cc2d2aQ8CFW7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms