Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo1Q8BFY9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnpo1Q8BFY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo1Q8BFY9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms