Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf7ipQ7TT18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf7ipQ7TT18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf7ipQ7TT18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf7ipQ7TT18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf7ipQ7TT18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf7ipQ7TT18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms