Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp397Q7TNK4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp397Q7TNK4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp397Q7TNK4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms