Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf4Q6PFF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf4Q6PFF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms