Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prm3Q62100 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms