Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps41Q5KU39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps41Q5KU39 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps41Q5KU39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms