Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp22Q5DU02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms