Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354cQ571J5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms