Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uspl1Q3ULM6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Uspl1Q3ULM6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uspl1Q3ULM6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms