Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gse1Q3U3C9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gse1Q3U3C9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms