Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms