Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SobpQ0P5V2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SobpQ0P5V2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SobpQ0P5V2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms