Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn2bQ0KL01 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms