Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb2P81069 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabpb2P81069 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb2P81069 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms