Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx1P70323 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx1P70323 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx1P70323 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx1P70323 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx1P70323 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx1P70323 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms