Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbx1P62878 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbx1P62878 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms