Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm2P58774 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms